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        人類(lèi)轉(zhuǎn)錄組中長(zhǎng)的非編碼RNA的景觀
        
 
         行業(yè)新聞 2020-10-12  
  
 
        
  
         
        
 
        
 
        
	　　2016年，10x Genomics公司推出ChromiumTM系統(tǒng)，這是一套分子條形碼和分析系統(tǒng)，由儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件組成，能夠?qū)覫llumina測(cè)序儀。
        
	　　長(zhǎng)的非編碼RNA(lncRNA)正在成為組織生理學(xué)和疾病過(guò)程(包括癌癥)的重要調(diào)節(jié)劑。為了描繪全基因組lncRNA表達(dá)，密歇根大學(xué)的研究人員從來(lái)自25項(xiàng)獨(dú)立研究的超過(guò)43 Tb序列的腫瘤，正常組織和細(xì)胞系中策劃了7,256個(gè)RNA測(cè)序(RNA-seq)文庫(kù)。他們將ab initio裝配方法應(yīng)用于該數(shù)據(jù)集，產(chǎn)生了91,013個(gè)表達(dá)基因的共有人轉(zhuǎn)錄組。
        
	　　
        轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
        
	 
        
	　　超過(guò)68%(58,648)的基因被分類(lèi)為lncRNAs，其中79%以前未被注釋。大約1%(597)的lncRNA含有超保守的元素，7%(3,900)與疾病相關(guān)的SNP重疊。為了優(yōu)先考慮譜系特異性，疾病相關(guān)的lncRNA表達(dá)，研究人員采用非參數(shù)差異表達(dá)測(cè)試并提名7,942個(gè)譜系或癌癥相關(guān)的lncRNA基因。這里描述的lncRNA景觀可以闡明正常生物學(xué)和癌癥發(fā)病機(jī)理，并且可能對(duì)未來(lái)的生物標(biāo)志物開(kāi)發(fā)有價(jià)值。
        
	　　
        轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
        
	 
        
	　　誠(chéng)邀各大測(cè)序公司及技術(shù)服務(wù)公司一起合作，為單細(xì)胞測(cè)序的發(fā)展貢獻(xiàn)力量。有合作意向請(qǐng)撥打：021-57790908，郵箱：zhujianming0374@163.com
        
	　　轉(zhuǎn)摘請(qǐng)注明出處：謝謝配合
        

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